בגינת הירק הישראלית, הפטרוזיליה היא עשב תיבול בסיסי שגדל כמעט בכל עונה. עם זאת, היא רגישה למספר מזיקים ומחלות. הנפוצים ביותר הם כנימות עלה (Aphids) המופיעות כמושבות זעירות בצבע ירוק או שחור על צדו התחתון של העלה ובקצות הצמיחה. הן מחלישות את הצמח ומפרישות טל דבש המושך פטריות. בנוסף, אקריות (קרדית) עלולות להופיע בתנאי יובש, וליצור קורים דקים וכתמים צהובים על העלים.
מחלות פטרייתיות נפוצות בפטרוזיליה כוללות טחב אבקתי (Powdery Mildew), ציפוי לבן אבקתי על העלים, וריקבון שורשים (Rhizoctonia, Pythium) המופיע בעיקר בתנאי עודף השקיה או ניקוז לקוי. טחב פלומתי (Downy Mildew) פחות שכיח אך עלול להופיע בחורף גשום ולח. זיהוי מוקדם הוא המפתח לטיפול יעיל.
לטיפול אורגני בכנימות, רססו תערובת של מים וסבון כלים עדין (כפית לליטר) או שמן נים (5 מ"ל לליטר) כל 3 עד 4 ימים. לאקריות, הגבירו לחות סביב הצמח על ידי ערפל במים, או ריססו שמן נים. כנגד טחב אבקתי, הכינו תמיסה של כפית סודה לשתייה בליטר מים עם טיפת סבון ורססו על העלים. הסירו עלים נגועים מיד. למניעת ריקבון שורשים, הקפידו על ניקוז טוב, השקיה מתונה (פעם ביומיים-שלושה בקיץ, פעם בשבוע בחורף) ואל תצפו את המים.
מניעה היא הטיפול הטוב ביותר: שתלו פטרוזיליה בעציצים או בערוגות עם אדמה מנוקזת היטב, ושמרו על מרווח של 15 עד 20 ס"מ בין צמחים. הימנעו מהשקיית יתר ומרסס עלים בשעות הערב. גידול בצל חלקי (לפחות 4 עד 5 שעות שמש ביום) מפחית לחץ. כמו כן, משכו חרקים מועילים כמו פרת משה רבנו על ידי שתילת שמיר או כוסברה בקרבת מקום. אם המזיקים נמשכים, שקלו שימוש בתכשיר אורגני על בסיס פירתרום, אך קראו תמיד את הוראות התווית.
