מלפפון הוא ירק קיצי מובהק, הנזרע באביב (מרץ עד אפריל) ונקטף לאורך הקיץ והסתיו (יוני עד אוקטובר). הזמן האידיאלי לקטיף הוא כשהפרי הגיע לאורך 10 עד 15 ס"מ (תלוי בזן), צבעו ירוק כהה ואחיד, והקליפה מבריקה וקשה למגע. אל תחכו שיצהיב, סימן זה מעיד על בשלות יתר, מרירות וזרעים קשים.
הקטיף עצמו פשוט: אחזו במלפפון ביד אחת, וביד השנייה החזיקו את הגבעול. סובבו בעדינות את הפרי עד שהוא נפרד מהגבעול, או חתכו במספריים נקיים כ-1 ס"מ מעל הפרי. הימנעו ממשיכה חזקה העלולה לפגוע בצמח. קטפו בבוקר או בערב, כשהטמפרטורה נמוכה, כדי לשמור על טריות.
אחרי הקטיף, שטפו את המלפפונים במים קרים וייבשו היטב. אחסנו במקרר בשקית ניילון מחוררת או במגירת הירקות, כך הם ישמרו על פריכותם עד שבוע. אל תשמרו ליד פירות שפולטים אתילן (כמו תפוחים, עגבניות) שמאיצים ריקבון. מלפפונים קפואים מתרככים, עדיף לאכול טריים תוך ימים ספורים.
קטיף תכוף (כל 2 עד 3 ימים) מעודד את הצמח להמשיך ולהניב פירות חדשים. השקיה סדירה בגידול חיונית, חוסר מים גורם למרירות. שימו לב: המלפפון אינו רעיל לחיות מחמד, אך קליפתו עלולה לגרום לגירוי קל בבטן אצל כלבים רגישים, רצוי לשטוף היטב לפני האכלה.
