בקיץ הישראלי החם, עגבנייה זקוקה להשקיה עמוקה ותכופה. השקה כל 2 עד 3 ימים, כ-2 עד 3 ליטר מים לצמח בוגר בכל השקיה. במזג אוויר קיצוני (גל חום מעל 35°C) יש להשקות כל יומיים, ואפשר להוסיף כיסוי קש סביב הבסיס לשמירת הלחות.
באביב ובסתיו, כשהטמפרטורות מתונות יותר, ניתן להפחית להשקיה אחת ל-4 עד 5 ימים, באותה כמות של 2 עד 3 ליטר. בחורף, העגבנייה כמעט ולא גדלה והשקיה מצומצמת ביותר, אחת לשבוע-שבועיים, תלוי בגשמים, רק כשהאדמה יבשה בעומק.
סימנים לעודף מים: עלים מצהיבים, נשירה, ריקבון שורשים ופירות סדוקים. סימנים לחוסר מים: נבילת עלים בשעות הצהריים, עלים מסולסלים, פירות קטנים ויבשים. בדוק רטיבות על ידי החדרת אצבע לעומק 5 עד 7 ס"מ, אם יבש, השקה.
השקה תמיד בבסיס הצמח, הימנע מהרטבת העלים כדי למנוע מחלות פטרייתיות. השקיית בוקר מוקדמת עדיפה, שכן המים מספיקים להיספג לפני החום הכבד. התאם את התדירות בהתאם למצע: אדמה כבדה מחזיקה מים יותר מחולית.
