עץ התפוז הוא ירוק-עד הזקוק להשקיה סדירה לאורך כל השנה, אך הכמויות והתדירות משתנות מאוד בין עונה לעונה. בקיץ הישראלי החם (יוני-ספטמבר), יש להשקות עץ בוגר אחת ל-3 עד 5 ימים, בהתאם לסוג הקרקע: בקרקע חולית כל 3 ימים, בקרקע כבדה כל 5 ימים. כמות המים המומלצת לעץ בינוני (גובה 2 עד 3 מ') היא 40 עד 60 ליטר לכל השקיה, תוך פיזור אחיד על כל אזור השורשים (מהגזע ועד לקו הטפטוף).
בחורף (נובמבר-פברואר) ההשקיה מצטמצמת משמעותית: אחת ל-10 עד 14 ימים, עם 20 עד 30 ליטר להשקיה. באביב ובסתיו (מרץ-מאי, אוקטובר) התדירות היא אחת ל-5 עד 7 ימים עם 30 עד 50 ליטר. חשוב להתאים את ההשקיה לגשם: אם ירדו מעל 30 מ"מ גשם בשבוע, אפשר לדלג על השקיה אחת. הימנע מהשקיית יתר הגורמת לריקבון שורשים ולנשירת פירות.
כדי לבדוק אם העץ זקוק למים, חדור אצבע או מקל לעומק 15 עד 20 ס"מ בקרבת הגזע. אם האדמה יבשה במגע, יש להשקות. סימני חוסר מים: עלים מסולסלים, נבילה בשעות הצהריים, צבע עלים עמום ופירות קטנים. סימני עודף מים: עלים מצהיבים, נשירת עלים תחתונים, כתמים חומים בשולי העלה וריח רע מהקרקע.
בעצים צעירים (שנתיים ראשונות) יש להשקות בתדירות גבוהה יותר: בקיץ כל יומיים-שלושה, 20 עד 30 ליטר, כדי לעודד התפתחות שורשים עמוקה. הדרך היעילה ביותר היא השקיה בטפטוף: 4 עד 6 טפטפות לעץ בוגר, טפטפת של 8 עד 12 ליטר לשעה, למשך 1 עד 1.5 שעות לפי העונה. הוספת שכבה של 5 עד 10 ס"מ חיפוי אורגני (קש, שבבי עץ) סביב הגזע תפחית אידוי ותשמור על לחות.
