השקיית קלמנטינה משתנה לפי עונה. בקיץ הישראלי החם (יוני עד ספטמבר) השקה כל 3 עד 4 ימים, כ-30 עד 40 ליטר לעץ בוגר בכל השקיה. בחורף (דצמבר עד פברואר) די בהשקיה אחת לשבועיים, 15 עד 20 ליטר, תוך התחשבות בגשמים.
באביב ובסתיו, כשהטמפרטורות מתונות, השקה כל 5 עד 7 ימים, 20 עד 30 ליטר. חשוב להתאים את התדירות לסוג הקרקע: קרקע חולית מתנקזת מהר ומחייבת השקיה תכופה יותר; קרקע כבדה שומרת לחות ויש להרויח בין השקיות.
סימני חוסר מים: עלים מסולסלים, נשירת עלים ופרי קטן ומקומט. סימני עודף מים: עלים מצהיבים, ריקבון שורשים, פריחה מועטה. בדוק רטיבות המצע על ידי החדרת אצבע לעומק 5 עד 10 ס"מ, אם האדמה יבשה, השקה; אם לחה, המתן.
השקה תמיד בשורש, הימנע מהרטבת העלים (למניעת מחלות פטרייתיות). השקה בשעות הבוקר המוקדמות או אחר הצהריים המאוחרים כדי להפחית אידוי. חיפוי (מאלץ') אורגני סביב הגזע יעזור לשמור על לחות הקרקע.
