עץ הלימון זקוק להשקיה סדירה ומאוזנת, לא יותר מדי ולא פחות מדי. בקיץ הישראלי החם, השקה כל 2 עד 3 ימים, ובמיוחד אם הוא גדל בעציץ. בחורף, די בהשקיה אחת ל-5 עד 7 ימים, תלוי בגשמים. המטרה היא לשמור על המצע לח, אך לא רטוב עד כדי שלולית.
כמות המים המומלצת לעץ בוגר בעציץ (קוטר 40 עד 50 ס"מ) היא כ-3 עד 5 ליטר בכל השקיה בקיץ, ובחורף 1 עד 2 ליטר. לעץ נטוע באדמה, כמות המים גדולה יותר, כ-10 עד 15 ליטר בקיץ, תלוי בגודל העץ. תמיד בדוק את לחות המצע בעומק של 5 עד 10 ס"מ לפני ההשקיה.
סימנים לעודף מים: עלים מצהיבים, נשירת עלים, וריקבון שורשים. סימנים לחוסר מים: עלים נבולים ומסולסלים, יובש בקצות העלים, ופירות קטנים ומקומטים. אם אתה מבחין באחד מאלה, התאם את תדירות ההשקיה מיד.
בדיקת רטיבות פשוטה: תקע אצבע או מקל עץ לעומק של 5 ס"מ במצע. אם יוצא לח, דחה את ההשקיה; אם יבש, הגיע הזמן. בקיץ, השקה בשעות הבוקר המוקדמות או הערב כדי להפחית אידוי. בחורף, הימנע מהשקיה בתקופות גשומות כדי למנוע ריקבון.
